Przy Kalwaryjskim Sanktuarium działają następujące ośrodki i grupy apostolskie:
- Duszpasterstwo Powołaniowo-Młodzieżowe OO. Bernardynów
- Franciszkański Zakon Świeckich
- Klub Myśli Chrześcijańskiej
- Franciszkańska Młodzież Oazowa
- Liturgiczna Służba Ołtarza oraz Schola
- Wspólnota Małych Przyjaciół św. Franciszka – zrzeszająca osoby niepełnosprawne ich rodziny i przyjaciół
- Klub Nowe Życie (AA) – Duszpasterstwo Trzeźwości
- Duszpasterstwo Narzeczonych – kursy przedmałżeńskie (okresowo)
- Specjalistyczna poradnia psychologiczno-rodzinna
- Grupa Zawierzenia Maryi
- Grupa św. O. Pio
- Odnowa w Duchu Świętym – Wspólnoty „Arka” i „Wieczernik”
- Arcybractwo Konającego Serca Jezusa i Matki Boskiej Bolesnej oraz Adoracji Nocnej w Rodzinie
- Pracownia Sztuki Sakralnej
- MOPS
